Последние новости
26.12.2024, 21:49 «Разведка – это жизнь». В «Российской газете» состоялся брифинг, посвященный Дню разведки
26.12.2024, 20:55 Пять рождественских ярмарок проекта «Креативный маркет» откроется в Москве в конце декабря
26.12.2024, 17:35 Компания «Симпреал» устроила новогодний утренник для первоклашек в пос. Новоорск
26.12.2024, 14:01 Будущее и настоящее отрасли недвижимости на конференции CORE.XP «Сила четырех» в Центре Событий РБК 18 февраля 2025 года
26.12.2024, 13:00 ФПК «Гарант-Инвест» сообщила о выплате 44,4 млн рублей по своим обязательствам
26.12.2024, 11:01 Новый ЖК бизнес-класса «Станиславский» от «ОМ Девелопмент» получит лобби и отделку квартир по проекту бюро BLANK
25.12.2024, 19:13 В российском турсервисе Russpass появился ИИ-помощник
25.12.2024, 16:15 Премия «Врач с большой буквы» присуждена 83 онкологам и гематологам из 9 регионов РФ
25.12.2024, 16:37 GAC представила новый бренд летающих автомобилей GOVY
25.12.2024, 15:10 EliTe Solar начинает строительство в Египте центра по производству солнечных панелей мощностью 5 ГВт
Новая жидкая биопсия улучшает обнаружение ДНК опухоли
Медицина
Исследователи Стэнфордского университета придумали способ значительно увеличить чувствительность метода для идентификации ДНК последовательностей из раковых клеток, циркулирующих в крови человека.
Как отметил ведущий автор Maximilian Diehn, есть надежда на то, что такие «жидкие» биопсии из легко получаемых образцов крови могут в один прекрасный день заменить необходимость хирургического получения опухолевой ткани для исследования.
Новый подход работает путем выявления ошибок, которые возникают, когда ДНК опухоли захватывается из крови и подготавливается для секвенирования. Удаление этих ошибок из результатов секвенирования позволяет ученым более точно определить раковые мутации. Diehn говорит: «Теперь мы можем обнаружить еще более точно наличие специфических мутаций в ДНК при раковых заболеваниях, которые могли бы помочь при выборе лечения или обнаружения остаточного рака. Мы становимся ближе к методу, который значительно снижает потребность в инвазивных биопсиях для выявления опухолевых мутаций или отслеживания реакцию на терапию».
Раковые клетки непрерывно делятся и умирают. Когда они умирают, они выпускают ДНК в кровь, своеобразные крошечные генетические сообщения. Умение читать эти сообщения — и выбрать один из 1 миллиона, которые приходят из раковых клеток, позволяет врачам быстро и неинвазивно контролировать наличие и объем опухоли, ответ пациента на терапию и даже то, как опухолевые мутации развиваются с течением времени в условиях лечения.
Исследователи назвали свой новый двусторонний подход «подавление интегрированный цифровой ошибки» или IDES. Он основан на ранее разработанном методе под названием САРР-Seq, способного захватить очень малые количества ДНК опухоли из крови путем поиска мутаций, связанных с определенными злокачественными опухолями. С помощью CAPP-Seq, исследователи смогли обнаружить всего лишь одну молекулу ДНК от опухоли из более 5000 нормальных фрагментов ДНК.
IDES основывается на CAPP-Seq, путем устранения технических ограничений: невозможность точно последовательность очень небольших количеств ДНК. Перед секвенированием, многие копии должны быть сделаны из каждого фрагмента двухцепочечной ДНК. Это копирование повышает вероятность ошибки в последовательности.
Исследователи нужен способ, чтобы определить, пришли ли мутации, выявленные в ходе процесса секвенирования, из опухоли или были введены в процессе секвенирования. Они разработали способ помечать циркулирующие молекулы двухцепочечной ДНК в крови «штрих-кодом». Поскольку нити отдельной молекулы ДНК подходят друг к другу, как молния, можно предсказать последовательность одной нити из последовательности другой. Таким образом, штрих-код позволяет исследователям найти две нити и искать расхождения. Кроме того, их подход разработан так, чтобы свести к минимуму число молекул, которые теряются во время штрихового кодирования и обработки образцов, что особенно важно при анализе небольшого количества циркулирующих ДНК.
«Наша методика является значительным шагом вперед по сравнению с предыдущими методами штрих-кодирования, поскольку она устраняет больше ложных срабатываний без ущерба для истинных позитивов. Помечая молекулы ДНК, мы можем отслеживать, какие молекулы были точно воспроизведены в процессе секвенирования и накопившиеся ошибки, которые не присутствовали в опухоли или крови пациента», добавил Diehn